1、肠套叠：
是婴幼儿应首先鉴别的疾病，常见于4～10个月大的肥胖男婴全年都可能生病，春天是高峰期。典型的临床表现是阵发性哭闹、呕吐、腹部香肠样包块和果酱样（血）粪便。阵发性哭闹是由折叠肠痉挛引起的，通常比简单的肠痉挛更重、更有规律。呕吐几乎发生在每个肠套叠中，而简单的肠痉挛则更为罕见。大多数儿童可以触摸腹部香肠样包块，通常位于结肠框架上，其中一半位于右上腹部。该包块比简单的肠痉挛所触及的肠道厚，具有一定的弹性和疼痛。如果发病超过6小时，果酱样粪便可能会排出。气体或钡灌肠可证实临床诊断（罕见的小肠套叠除外），并可通过增加灌肠压力试验复位。
2、急性阑尾炎：
急性化脓性阑尾炎多发生在5岁以上儿童，但并非不可能发生在婴儿期。阑尾炎的典型症状是转移性右下腹痛。在发病初期，儿童经常报告中腹或上腹痛，有些不能确定腹痛部位。此时，它可以与肠痉挛混淆。几个小时后，腹痛主要固定在右下腹。腹痛一般是可持续的，但阑尾炎，如粪石梗阻和阑尾寄生虫，在一段时间内可以是阵发性和痉挛性疼痛，也应与肠痉挛相识别。识别要点是各种阑尾炎必须有右下腹固定压痛。如果病程稍长，可能会出现肌肉紧张，这与肠痉挛不同。有时需要几次检查来确定压痛点是否固定。此外，阑尾炎常伴有早期恶心、呕吐、后期发热和白血球增加。
3、急性胃肠炎或肠道感染：
可发生发生在所有年龄段的儿童身上。除阵发性腹痛外，还可能出现呕吐、腹泻和发烧等症状，有时会因呕吐和腹泻而脱水。以上是单纯肠痉挛不应有的表现，但在发病初期仍需与肠痉挛区分开来。肠道感染，包括细菌性痢疾和阿米巴性痢疾，应结合粪便实验室检查进行诊断。
4、肠系膜淋巴结炎：
儿童更为常见，一般有上呼吸道感染史。儿童经常自我报告为隐性腹痛，非阵发性。有时腹痛部位不能确定，但也往往是右下腹痛，因为回、结肠系膜富含淋巴组织。体检可能有右下腹压痛，但压痛点不固定，也不伴有肌肉紧张。怀疑肠系膜淋巴结炎不要忘记检查儿童的喉咙和肺。
5.肠蛔虫和胆道蛔虫:
肠蛔虫症引起的腹痛实际上也是一种肠管痉挛性疼痛，且呈阵发性，有时出现呕吐与腹部压痛，难以触及蛔虫团。本症虽与肠痉挛临床表现相似，但因治疗方法不同，故还应力求作出鉴别。胆道蛔虫的典型临床表现是剧烈的阵发性腹痛，上腹部偏右为疼痛最重点，可伴有局部的压痛与肌紧张。胆道蛔虫有时与肠蛔虫症并发，应予以注意。蛔虫并发症与国民的卫生条件和生活习惯有关，因此诊断必须结合病史。虽近年来本症有所减少，但在卫生条件较差的农村仍为常见病。
6、便秘：
慢性便秘通常不会引起腹痛，但由暂时原因引起的便秘通常会诱发乙状结肠痉挛和阵发性腹痛。这种疾病主要发生在儿童身上。腹痛通常发生在下腹或左侧，有时会触及痉挛性肠道或/和干硬大便块。用开塞露或肥皂水灌肠排便后，腹痛通常可以缓解或消失。此外，婴儿甚至新生儿有时在排便前哭泣，排便后哭泣消失。目前尚不清楚是由局部刺激还是神经反射引起的肠道痉挛。
