导致恐惧症的原因是多方面的，既有长期的、前置的（例如遗传、童年经历等），也有短期的、突发性的（例如遭遇意外事故、生活发生巨变等），甚至个体的病理因素也可能导致恐惧症的产生：

关联和回避

以针尖恐惧症为例，相当一部分患者小时候其实是不怕针的，然而如果身边的人对扎针出现了极度惊恐的反应，那么孩子也会受到大人的情绪感染从而把扎针和恐惧情绪关联起来。从此之后，孩子可能一看到针就焦虑不安，并开始回避一切跟扎针有关的情景，甚至在长大之后也难以释怀，之后变成针尖恐惧症患者。

遗传原因

遗传学家们发现某些特殊的基因与焦虑之间有着千丝万缕的关系。比如，他们发现在人体第17对染色体上存在的一种叫SERT的基因（又称为血清素转化基因）能够影响人们对压力的敏感程度。具体来说，SERT基因越长，越不容易产生焦虑的情绪，换句话说，这些人患上恐惧症的概率也就越小；反之，从父母那里继承的染色体上的SERT基因越短的人则越容易产生焦虑，患上恐惧症的概率也会越高。从这个角度来看，恐惧症确实有可能会遗传。

原生家庭

虽然有遗传的因素，但恐惧症的养成并不都是基因的原因。心理学家家伯恩在书中提到，他在从事焦虑症治疗的20多年里，接触到的近四分之一的恐惧症患者都来自问题家庭。这些患者从小就在极度缺乏安全感的环境中成长，这些孩子长大后有的可能很难再相信他人，认为这个世界是危险的、不值得信任的，存在严重的情感回避；有的可能会有强烈的取悦他人的渴望，认为自己必须做到人见人爱。当这些不理智的信念发展到一定程度时就会变成焦虑的源头，从而使人患上恐惧症。

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