靠近尿道口的小结石，可注入大量石蜡油试行挤出，或用蚊式钳、尖镊将其夹出，亦可将探针的前段弯成钩状，试行将结石勾出。但结石较大者不宜勉强反复试挤结石，避免造成尿道粘膜广泛损伤。
嵌于尿路外口的或舟状窝的结石，有时需切开尿道外口取出结石。后尿道的结石可用尿道探将其推顶回膀胱，再用经尿道机械碎石钳将其夹碎或行耻骨上膀胱切开取石术。尿道憩室内有结石者应将憩室与结石一并切除。结石紧嵌于前尿道不能取出或推回膀胱者，在阴茎侧边作直切口，将切口拉向中央，再切开尿道摘取结石，并用肠线分层缝合，防止术后尿瘘形成。偶有在尿道前列腺部和膀胱顿的哑铃状大结石，需切开膀胱，缓慢松动结石完整取出。由于结石长期嵌于后尿道，结石取除后可能出现尿失禁。
1.舟状窝内结石小的可用镊子取出，大的不能通过尿道外口者可将结石钳碎或经麻醉后切开尿道外口后取出。
2.前尿道结石可在麻醉下于结石近侧压紧尿道，从尿道外口注入液体石腊，用钩针钩取，如不能取出，用金属探条将结石推回到尿道球部，行尿道切开取石，但应避免在阴茎部切开尿道取石，以免发生尿道狭窄或尿道瘘。
3.后尿道结石需在麻醉下用金属探条将结石推回膀胱，再按膀胱结石处理。
4.尿道憩室合并结石时，应将结石取出的同时切除憩室。
5.尿道结石合并尿道及尿道周围感染时，应先行膀胱造瘘，尿流改道，待感染控制后再行尿道内取石术。
