对于再障患者而言，令人头疼的问题莫过于病情的反复发作，病程超长，而很多再障患者也需要长期服药维持治疗效果。但多数患者由于缺乏用药常识，导致患者产生药物依赖性，用药成瘾，伤害患者的肝肾功能，终也不能确定到底是“治病”还是“致病”?
长年用药的再障患者，肝肾内堆积了大量的毒素药物，因为超负荷，所以肝肾起不到解毒作用，导致肝肾功能衰竭，脏腑遭受药物侵袭，也造成衰竭。
另外脾胃因为长年吃药，吸收能力大大减弱，体质下降，这样恶性循环，导致营养吸收不进去，有毒物质排泄不出来，长此以往，患者抵抗疾病能力越来越弱，身体素质越来越差，很多再障患者甚至服用多种药物，导致药效降低，增加了副作用，导致很多再障中老年患者身体不堪一击。
长期食用医药对儿童的生长激素有阻碍作用，儿童长期应用能抑制骨的成长及蛋白质合成。孕妇应用可能引起胎儿畸形。还可以使胃酸、胃蛋白酶分泌增多，又能减少胃粘液分泌，降低胃肠粘膜的抵抗力，故可诱发或加剧胃、十二指肠溃疡病，甚至造成消化道出血或穿孔。
长期食用西药可发生耐药性。个别病例可诱发精神病。儿童应用大剂量可引起惊厥。癫痫病人还可诱发癫痫发作。
同时，很多再障患者，因为医生的滥用抗生素而治疗不当，造成某些再障患者的巨大副作用。
大多数再障患者都会采取激素治疗，经常使用激素，患者容易产生对激素的依赖导致肾上腺功能衰竭，病情加重。如果使用单一西药治疗副作用太大，效果也起不到治本的作用，因此患者一定要慎重选择治疗方法。
