典型的尿道结石，很容易被临床医生诊断出来，但有些尿道结石临床症状不明显，往往与某些疾病容易混淆。须与尿道结石鉴别的尿道疾病有：
1、尿道狭窄尿道狭窄的主要症状为排尿困难，尿流变细无力中断或滴沥，并发感染时亦可有尿频尿急尿痛及尿道分泌物，某些外伤性尿道狭窄亦可能扪及尿道硬结。
尿道狭窄往往无肾绞痛史及尿砂石史而有其原发病因，如损伤炎症或先天性医源性等原因；其排尿困难非突发性；尿道探通术可于狭窄部位受阻；X线平片无结石阴影尿道造影可显示狭窄段。
2、非特异性尿道炎 非特异性尿道炎时，可有尿痛尿频尿急及尿道分泌物慢性，非特异性尿道炎可并发尿道狭窄而出现排尿困难。
非特异性尿道炎，无肾绞痛或尿砂石史无急性排尿困难尿道扪诊不能触及硬结，X线检查无结石阴影。
3、尿道损伤 尿道损伤可有尿道外口出血，尿道内疼痛及排尿困难尿潴留并发感染时可有尿道分泌物。
尿道损伤一般有明确损伤史，常伴尿外渗局部皮肤肿胀皮下瘀血试插导尿管不易插入膀胱。并可由导尿管引出数滴鲜血X线平片可见骨盆骨折等征象无结石阴影。
4、尿道痉挛 由于尿道括约肌痉挛可有尿道疼痛和排尿困难等症状，往往由精神紧张局部刺激等因素引起。
尿道痉挛无尿砂石史及尿频尿急等症状不能扪及尿道硬结尿道，探通术可正常通过X线检查无异常用镇静剂后症状可缓解。
5、尿道异物 尿道内异物引起尿道梗阻时可出现排尿困难甚至尿潴留，异物刺激或继发感染时可有尿频尿急尿痛及血尿。
但有其病因可寻、X线检查可见尿道内充盈缺损尿道镜检查可见异物。
