尿道结石的诊断方法是根据其症状判断的，首先是排尿时疼痛、排尿困难和感染症状。一般为钝性疼痛，但也可以是锐利的，并常放射至阴茎头部。前尿道结石的疼痛常局限于结石嵌顿处，后尿道结石的疼痛常放射至阴茎头、会阴或肛门。由于尿道结石引起梗阻，引起排尿困难，尿线变细、滴沥，甚至急性尿潴留。有时出现血尿。
合并感染时可出现膀胱刺激症状及脓尿，对阴茎部尿道结石，患者常能扪及。并主诉在排尿时结石梗阻部尿道近侧隆起伴有胀痛。
结石嵌顿于尿道、梗阻严重以及伴有感染时，可引起严重症状，如剧烈疼痛、急性尿潴留、尿外渗、会阴部脓肿及尿道瘘等。嵌顿于后尿道的结石偶尔可引起急性附睾炎症状如发热、附睾肿大和疼痛。
症状明显，就要根据以下方法进行确诊。
一、x线检查
1、平片
一般平片即可确诊，可明确结石部位、大小及数目。尿道结石多为单个，以圆形或卵圆形多见。尿道憩室结石也多为单发，大小不一。但这只是确诊的初级阶段，我们还需要清楚的知道尿道里面的情况。
2、尿道造影
可进一步证实结石在尿道的具体位置，并可观察尿道狭窄和憩室情况等。
二、B超检查
B超检查可发现尿道内结石光团及其声影，尤其容易发现嵌顿于前列腺尿道的结石。
