肛周脓肿会复发，但一般不会频繁复发。通常来讲，如果肛周脓肿患者采取保守的药物治疗方式，是不会有太好的治疗效果的，就算短时间内症状消失，在停药后也很容易复发。而如果采用肛周脓肿切开引流术，术后大部分会形成肛瘘，它会反复的肿胀、疼痛、破溃、流脓，所以如果做切开引流术，也是容易复发。肛周脓肿可能会一辈子频繁复发。因为肛周脓肿属于一种感染性的疾病，主要是由于肛窦的炎症反复发作所导致的。肛窦位于肛管齿状线的部位，有多个肛窦，可以出现继发感染。肛周脓肿如果治疗不及时，或者手术以后换药不充分，也会遗留有残腔，这都是导致复发的原因，并且反复发作就会形成慢性肛瘘。
