婴幼儿肛瘘发病初期先是肛周脓肿，在肛周鼓起一脓包，局部红肿热痛，脓肿溃破后肿消痛减，破溃口淋漓不断地流水流脓，外口时闭时溃，外口封闭后内口不闭，就很容易再次感染。脓肿溃破了就是肛瘘。
婴幼儿肛瘘一般是低位的，有内口（在肛门内）、外口（在肛周皮肤上的溃口）、管道三部分，内口与外口之间由管道相连。使用肛瘘膏时要将药物注入肛门内，由于肛瘘管道短注药后药膏可能会从肛门溢出，如不用卫生纸将药膏擦净，就很容易从肛瘘的外口处灌入管道内，肛瘘膏的作用是让内口闭合，切断了感染源，使细菌不能入侵，外口应让它敞着，使管道内的炎性分泌物能以排泄出，这样肛瘘的炎症才能慢慢消退，达到治疗目的。
如果药膏注入肛瘘管道内，很容易堵塞管道，使炎性分泌物引流不畅，内口没有闭时，细菌由此进入就会加重炎症反应。
曾有一女童的直肠阴道瘘用肛瘘膏治疗近3个月了，效果明显，仍在继续治疗。
有时家长会问：肛瘘外口涂什么药膏好，我认为外口什么药也不要涂，让其敞着口流分泌物这样患者就不会有疼痛。肛瘘周围肿胀时可以在肿胀的外围及肿胀处涂些消炎散结的药膏。
