1、单纯性肛瘘：
a、低位单纯性肛瘘：
仅有一个瘘管，一个内口和一个外口之完全瘘。内口在齿线处，管道通过外括约肌浅部或浅部以下。
b、高位单纯性肛瘘：
仅有一个瘘管，内口在齿线或齿线以上，管道行径在外括约肌深层以上，或穿行于直肠粘膜下，而不穿过肌肉者（包括内盲瘘及全内瘘）。
2、复杂性肛瘘：
3、马蹄形肛瘘：
瘘管环行，外口在肛门部两侧，内口多在截石位6点或12点处。又有前位、后位、前后位马蹄形肛瘘之分。
a、前位马蹄形肛瘘：
瘘管环行，外口在肛门前方两侧扩散到会阴及阴道瘘，外口若在肛缘2、5cm以内，内口就在对侧。若在2、5cm以上者，内口可能在后侧。
b、后位马蹄形肛瘘：
瘘管环行，管道向肛门后两侧扩散，距肛缘较远较深，有多数外口，多数瘘管管腔相互贯通，内口大多在肛门后侧。
c、前后位马蹄形肛瘘：
瘘管环行围绕肛管，外口肛周一圈都有，少则几个，多则几十个，大面积被侵犯，管道行径复杂。
