肛瘘根据严重程度不同以及医院级别不同收费也是有差异的，比如二级医院一般肛瘘的手术费用300到手500元，加上后续治疗，换药等大概，5000左右，如果是三级医院手术费用1000元左右，总的住院费用8000左右。如果为复杂性肛瘘，费用还会增加，建议到正规医院专科进行治疗，防止肛瘘复发，或者损伤肛门功能。