针灸治病是采用独特的针刺和艾灸等方法来达到其防治疾病的目的，具有调和阴阳、扶正祛邪、疏通经络的作用。
调和阴阳
疾病的发生，从根本上来说是阴阳的相对平衡遭到破坏，出现偏盛偏衰的结果。对于这些脏腑经络功能失常的病理变化，运用针灸方法则可以调理阴阳，补偏救弊，恢复阴阳相对平衡，促进阴平阳秘，保持精气充沛，形气相合，神气内存。
针灸调和阴阳的作用主要是通过经络腧穴配伍和针刺手法来实现的。例如：胃火炽盛引起的牙痛，阳热偏盛，治宜清胃泻火，取足阳明胃经腧穴内庭，针刺泻法。
寒邪伤胃引起的胃痛，属阳邪偏盛，治宜温中散寒，取足阳明胃经腧穴足三里和胃之募穴中脘，针刺泻法，并灸。
肾阴不足、肝阳上亢引起的眩晕，属阴虚阳亢证，按着“阴病治阳，阳病治阴”的原则，治宜育阴潜阳，取足少阴肾经腧穴太溪，针刺补法;取足厥阴肝经腧穴行间，针刺泻法。
脾阳不足引起的慢性泄泻，属阳虚阴盛，治宜温阳散寒，取足太阴脾经腧穴阴陵泉等穴，针刺补法，并灸。
由于阴阳之间可以相互化生，相互影响，故治阴应顾及阳，治阳应顾及阴，在调和阴阳时，常采用“从阴引阳，从阳引阴”的方法，临床上最常见的是运用募穴、背俞穴来调养脏腑的阳气和阴气。
扶正祛邪
疾病的发展过程，是正气和邪气的相互斗争的过程，正邪力量消长决定疾病的发展和转归，邪胜于正则病情加重，正胜于邪则病情减轻，因此，扶正祛邪是保证疾病趋向良性转归所不可缺少的。针灸治病，就在于能够发挥其扶助正气，祛除邪气的作用。
针灸扶正祛邪的作用主要是通过针刺手法和腧穴配伍来实现的。例如：
在刺灸方面，针刺补法和艾灸都有扶正的作用;反之，针刺泻法和刺血疗法都有祛邪的作用。
在腧穴配伍方面，膏肓俞、气海、关元、命门等穴，多在扶正时选用;十二井穴、十宣、人中等穴，多在祛邪时选用。
如见面色苍白，大汗淋漓，四肢厥冷，脉微的虚脱证，治宜回阳固脱，急取关元、神阙，大艾炷灸之，并取足三里，针刺补法。如见高热神昏，烦躁口渴，脉洪大而数的外感温热证，治宜泻热开窍，取十二井穴用三棱针点刺出血，再取大椎、曲池针刺泻法。
扶正与祛邪，方法不同，但二者相互为用，相辅相成，既可先祛邪后扶正，又可先扶正后祛邪，或扶正与祛邪并用。一般以“扶正不留邪，祛邪不伤正”为原则，只有这样，才能取得预期的疗效。
疏通经络
经络系统遍布体内，纵横联系，交叉出入，沟通表里，联系上下，构成人体气血运行通路，维持人体正常生理功能。若由于种种原因，导致经络不通，脏腑肢节失却温煦濡养，气血闭阻，则会疾病丛生，或滞或瘀，或虚或实，或寒或热，或气血失和，或阴阳偏颇。针灸治病则可利用其“疏通经脉，调和气血”的作用，根据经络与脏腑在生理病理上相互联系，相互影响的机理，在经络循行分布路线和联系范围内选取一些腧穴，进行针刺或艾灸，使经络畅通，营运有度，气血调和，阴阳平衡。
