在肛肠疾病中，绝大多数的肛肠疾病可通过肛门指检作出初步。
人指感觉敏锐、活动灵活，可以发现很小的结节、溃疡，并触清其范围、硬度、位置和有无脓血粘液。
有人称其为“指诊眼”：认为是肛管直肠疾病检查中重要的方法之一，是对发现早期直肠癌有重要价值。
肛门直肠疾病在临床症状上有许多相似之处，如“便血”一症，就有许多疾病可出现，临床上不能仅凭主诉和症状就作出，而必须简单的检查肛门指检。
肛门指检有以下几种体位
1、侧卧位
通常采用左侧卧位，有时因身体的原因或诊治的需要，亦可采用右侧卧位。正确的侧卧位姿式是臀部靠近床边，上侧的髋膝各屈曲90度，下侧髋膝屈曲成45度。此体位适用肛门直肠小手术或病重、年老体弱的检查;
2、膝胸位
双膝屈起，跪伏床上，肘关节紧贴床铺，胸部尽可能下压，臀部抬高。这是目前常用的检查体位，但不能持久，病重或老年体弱者不宜采用;
3、蹲位
下蹲作深呼吸，用力增加腹压，作排便状，适用检查直肠脱垂、直肠息肉、痔脱出和直肠肿瘤位置稍高的。
肛门指检在肛肠检查中的意义
1、直肠癌：大多数可以通过肛门指检发现。在直肠黏膜上有结节突出可摸到高低不平，形如菜花状。
2、直肠息肉、纤维瘤：在直肠黏膜上，指尖可摸到圆形或椭圆形，光滑柔软肿块，无疼痛，指尖带血。
如触及呈卵圆及锥形，质硬肿块，有压痛，则多为纤维瘤。
3、直肠脱垂：指检触及肛门括约肌松弛、直肠黏膜柔软呈折叠状，黏膜光滑松弛移动。
4、肛门直肠瘘：指检在齿现状线附近的肛隐窝处触及硬结或凹陷多为肛瘘的内口，肛门外无外口相通者为外内瘘，有外口相通者为全瘘。
如内口位置与肛周溃破的外口呈放射状相对应，多为单纯性底位肛瘘。
5、肛乳头瘤、肛乳头炎：指检在齿线处可摸到长蒂状质地中等、圆形可推动肿块，指套干净，为肛乳头瘤。指检肛门紧缩，在齿线处可摸到变硬、疼痛的凹陷，也可摸到变硬肥大的乳头，为肛乳头炎。
6、内痔：指检时肛门括约肌不紧张，在齿线上摸到柔软圆形、不固定单个或多个包块。为二期内痔。
一期内痔不易摸到。三期内痔因反复脱出、黏膜增厚、粗糙、活动度大。如血栓形成。可摸到变硬的肿块。
7、肛裂：指检因肛门括约肌挛缩，肛门收缩变紧，会加剧疼痛，一般不做肛门指检。必要时可在麻醉下指检。
8、肛门狭窄：指检时，肛门和直肠腔狭小，不能通过手指，大便呈细条状。
9、肛门失禁：指检肛门呈松弛状，肛门常有大便附着。令收缩肛门，手指无括约肌收缩感。不能自制稀便者为不完全失禁，不能自制干便者，为完全失禁。
