女孩子月经来得早与长得矮之间有一定的科学依据。
一、骨骼发育方面
生长板闭合
人的身高增长主要是依靠长骨两端的生长板（骨骺）不断地增殖生长。在青春期，性激素（如雌激素）会促使生长板加速生长，让孩子在短期内身高增长加快。然而，月经初潮是女孩青春期性发育的一个重要标志，它意味着女孩的雌激素水平已经上升到了一定程度。
月经来潮后，雌激素会持续作用，使得生长板的软骨细胞增殖速度逐渐减慢，导致生长板闭合。一般来说，生长板一旦闭合，长骨就不再生长，身高也就基本定型。月经来得早的女孩，其生长板闭合相对也会较早，这就缩短了身高增长的时间。例如，正常情况下，女孩的生长板可能在14-16岁左右闭合，但月经初潮较早（如10-11岁）的女孩，生长板可能在12-14岁就闭合了，从而影响终身高。
生长激素和性激素的相互作用
生长激素是促进身高增长的关键激素。在青春期前，生长激素在身高增长过程中起着主导作用。但进入青春期后，性激素开始大量分泌，它和生长激素之间存在复杂的相互作用。月经初潮早的女孩，较早受到大量性激素的影响。
高水平的性激素会改变生长激素的分泌模式，使得生长激素分泌的脉冲幅度和频率发生变化。在某些情况下，这种变化可能导致生长激素分泌减少，进而影响身高增长。而且，性激素还会使骨骼成熟加速，与生长激素对身高增长的促进作用相互拮抗，导致身高增长的时间缩短。
二、其他因素综合作用
营养因素
月经初潮早的女孩可能在营养需求方面面临更大的挑战。因为月经期间会有一定量的失血，需要足够的营养来补充铁、蛋白质等营养物质，以维持正常的身体发育。如果营养摄入不足，尤其是钙、维生素D等与骨骼健康密切相关的营养素缺乏，会进一步影响骨骼的生长发育。
例如，有些女孩在月经初潮后没有及时调整饮食，钙摄入不足，骨骼无法获得足够的矿物质沉积，会影响骨骼的强度和生长潜力，间接导致身高增长受限。
心理因素
月经初潮早可能会给女孩带来心理压力。在同伴还没有经历月经时，自己较早出现这种生理现象，可能会让女孩感到困惑、焦虑甚至自卑。这种负面情绪可能会影响食欲、睡眠质量等，而良好的睡眠和充足的营养摄入是身高增长的重要保障。
长期的心理压力还可能影响内分泌系统的平衡，进一步干扰生长激素等与身高相关激素的正常分泌，从而对身高产生不利影响。
