直肠息肉有很多检查方法可以发现，简单的方法即为医生指诊。如果是有经验的医生，特别是肛肠科医生，指诊是宝贵的诊断方法，所以几乎对于所有肛肠科的病人需要进行直肠指诊，可以发现不同情况的直肠息肉有增生的情况。
使用时间较长的辅助检查方法是进行钡灌肠检查，钡灌肠检查在结果上可表现出有充盈缺损。充盈缺损是指息肉占据一部分位置，使钡无法填充显影，缺失一部分影像，影像缺失的大小即说明息肉的大小。但是检查存在局限性，有时候可能较小的息肉无法发现，因此目前已经逐渐被清晰、直观的结肠镜检查替代。
目前无论是电子结肠镜还是光学结肠镜检查，对于发现直肠息肉都是好的诊断和检查方法。进行结肠镜检查的相对痛苦比较小，如果结肠镜检查能够得到普及，结直肠息肉和早期结直肠癌发现的几率将会非常高。如果存在肠道症状或者存在家族病史，在40岁以前一定要进行一次结肠镜体检。
