结石的诊断明确之后就要尽早进行相应的治疗了。

传统上，下颌下腺远中段小结石通常采取扩张导管口，酸刺激等保守方法帮助结石自行排出；不能自行排出或体积较大的结石采取口底粘膜切开取石的方法。随着设备及技术的进步，对于下颌下腺腺门段结石，可采取的经口内入路下颌下腺取石术，不再摘除腺体，成功率为82%~98%。

此外，对于一些病例还可以采用体外碎石术治疗，即在超声引导下，碎石探头产生冲击波，研究显示，体外碎石术可完全清除50%~58%的结石，76%~的患者症状有所改善。

近20余年来，涎腺内镜设备及微型外科器械得到了不断的改进，出现了许多不同硬度、不同直径的多工作通道涎腺内镜，采用涎腺内镜配套的微型外科器械，外科医师可进行取结石的操作。可以不破坏导管口，或仅做很小的切口就可将结石取出。取出结石后，可再次探查，确定是否有结石残余，以减少术后症状复发的可能性。