念珠菌性龟头炎一般比较难以，需要进行规律有效的治疗。念珠菌性龟头炎属于真菌性的龟头炎，难治的原因：
、是一种条件致病菌，正常情况真菌不会感染，当人体存在有免疫下降，或者正常菌群被破坏，才会造成念珠菌或者真菌繁殖而导致感染，所以是一种条件致病菌。如人体存在口服免疫抑制剂或者伴有糖尿病，或者长期大量的口服抗菌素而导致正常菌群破坏，才会合并有真菌的感染，一旦感染，往往难以清除。
第二、真菌感染时用药疗程不足，会造成感染难以控制，有时使用抗真菌的药物，短期内起效以后就停止相关的药物，正规抗真菌感染需要至少两周，即便症状完全消失以后，仍要按疗程治疗，再复查真菌转为阴性后才可停药。如症状缓解后停药，可能真菌尚未完全，所以会造成龟头炎，长期不愈。
第三、当合并有包皮过长或者包茎等，造成局部慢性缺氧，真菌繁殖，则可以造成真菌感染，长期不愈合。
所以进行抗真菌感染的同时，需要进行包皮环切手术来减少局部慢性缺氧和遮盖，才能达到的效果。
