在南京市，有多家中医院擅长治疗尖锐湿疣，但要说哪个更好，还需根据患者的具体情况和医院的综合实力来判断。以下是对南京市几家知名的、在治疗尖锐湿疣方面有着丰富经验的中医院的介绍：

一、南京市中医院

南京市中医院是一所集医疗、教学、科研为一体的大型中医医院，其皮肤性病科在治疗尖锐湿疣方面积累了丰富的经验。该科室的医生团队专业素质高，能够根据患者的具体病情制定个性化的中医治疗方案。南京市中医院采用中药内服和外用中药等疗法，旨在不仅消除尖锐湿疣的疣体，还能调节患者的体质，减少疾病的复发。同时，医院还注重患者的心理疏导，帮助患者树立战胜疾病的信心。

二、南京圣贝中西医结合门诊（南京圣贝医院）

南京圣贝医院在治疗尖锐湿疣方面也有着较高的知名度和专业水平。该医院采用中西医结合的治疗方法，结合传统的中医理论和现代医疗技术，为患者提供全面的治疗服务。南京圣贝医院在尖锐湿疣的治疗上，特别注重个性化方案的制定，根据患者的体质、病情和病史等因素，合理组方用药，以达到更好的治疗效果。此外，医院还注重患者的隐私保护，提供温馨、舒适的就诊环境。

除了以上两家医院，南京市还有其他一些中医院在治疗尖锐湿疣方面也具有较高的专业水平。例如南京中医药大学附属医院、江苏省中医院等，这些医院都拥有专业的医生团队和更好的诊疗设备，能够为患者提供全面、科学的治疗服务。

在选择治疗尖锐湿疣的中医院时，建议患者先了解医院的资质、医生团队、治疗方法和费用等方面的信息。同时，也可以参考其他患者的评价和反馈，以便更好地选择适合自己的医院。此外，患者在治疗过程中应积极配合医生的治疗方案和建议，保持良好的生活习惯和饮食习惯，以促进疾病的康复。

综上所述，南京市有多家中医院擅长治疗尖锐湿疣，患者可以根据自己的实际情况和需求选择适合自己的医院进行治疗。