肛内感染HPV（人乳头瘤病毒）后，病毒是否能够被清除取决于多种因素，包括感染病毒的型别、患者的免疫系统状态、是否接受了及时有效的治疗等。

首先，需要明确的是，部分HPV感染确实具有自限性，也就是说，在一定条件下，病毒可能会自然消退。这主要依赖于患者的免疫系统能否有效识别和清除病毒。对于肛内感染HPV的情况，如果感染的是低危型HPV，且患者免疫系统功能正常，那么病毒有可能在数月或数年内被自然清除。然而，这一过程并不是绝对的，也并非所有感染都能自行消退。

对于高危型HPV感染，特别是那些与肛门癌等恶性肿瘤发病密切相关的型别，如HPV16、18等（虽然问题中询问的是HPV58，但此处的讨论同样适用，因为HPV58也属于高危型），其自然消退的可能性相对较低。这些病毒更容易在人体内持续存在，并可能导致细胞异常增生和癌变。因此，对于高危型HPV感染，特别是肛内感染的情况，患者应及时就医，接受专业医生的评估和治疗建议。

治疗肛内HPV感染的方法可能包括药物治疗、物理治疗（如激光、冷冻等）以及手术治疗等。具体治疗方案应根据患者的具体情况而定，由专业医生制定。治疗的目的是缓解症状、去除疣体（如存在）、防止病毒扩散以及降低癌变风险。

除了专业治疗外，患者在日常生活中也需要注意个人卫生和防护。保持肛门部位的清洁和干燥，避免不洁性行为，使用避孕套等防护措施可以降低病毒传播的风险。同时，增强免疫力也是预防HPV感染和减少复发的重要手段。

总之，肛内感染HPV后，病毒是否能够被清除取决于多种因素。对于高危型HPV感染，特别是肛内感染的情况，患者应及时就医并接受专业治疗。通过合理的治疗和良好的生活习惯，大多数患者可以在一定程度上控制病情并降低癌变风险。