免疫抑制治疗增加移植后的癌症发病率，然而，免疫抑制不是移植继发肾细胞癌的独立的危险因素。

几种机制被假定为供者源性细胞向恶性转化的原因。这包括病毒或者癌基因从主体到供体细胞的转染，继而因改变了的免疫监视、供体的慢性抗原刺激和供体的细胞老化而增强。

肾细胞癌是肾移植术后报道多的恶性肿瘤。尽管绝大多数肾移植后恶性肿瘤涉及非泌尿系器官，原生肾的肾细胞癌占所有肿瘤的5％-15％，而移植肾的肾细胞癌仅占0.5％-1.5％。

对于移植受者来说，肾细胞癌大的危险因素是获得性囊性肾脏疾病。持续的移植前透析增加了患移植后肾细胞癌的风险。

因此，很多中心对原生肾和移植肾定期做超声检查。很多同种异体肾脏移植后肿瘤是偶然发现的，并且在已故患者比活着的患者更为常见。

当确诊以后，肾移植恶性肿瘤往往较小（小于4厘米）并且活检定性的级别较低。虽然大多数原生肾的肾细胞癌是透明细胞癌，但大多数移植肾的肾细胞癌是乳头状肾癌。

移植受者大范围切除肿瘤后，肿瘤复发的风险或者转移的风险非常低。在关于移植肾肿瘤的一系列大规模报道中，没有人死于癌症。利用来自有已知恶性肿瘤病史的供者的器官或者有活动性低级别恶性肿瘤患者的捐献将增加器官捐献池。

同种异体移植肾脏肿瘤的治疗曾经是移植肾切除，因为可以预期到免疫抑制的患者会有一个较差的预后。然而，现在认为免疫抑制并没有加速原位进展、转移或者移植肾脏肿瘤。

事实上，肾功能障碍导致死亡的风险已经超过肿瘤本身，当肿瘤体积较大不适合保留肾脏时，或者移植物的其他转移性肾细胞癌，才考虑同种异体肾切除、终止免疫抑制和开始透析的。同时，也冷冻消融或射频消融治疗作为一种创伤较小的治疗选项。