腔隙性脑梗塞多数患者可以治好，有些患者可以无任何临床症状和体征，只是检查颅脑CT或者颅脑核磁时出现脑内梗死灶。该患者一般情况下不需要进行特殊的治疗，可以口服阿司匹林抗血小板聚集，同时控制患者的病因。
如果患者出现症状和体征时，大多数表现为局灶性症状和体征，可以出现纯感觉性卒中，也可能会出现纯运动性轻偏瘫。该患者的治疗主要是给予抗血小板聚集，以及神经保护和改善血液循环治疗。神经保护治疗的药物，可以应用依达拉奉、胞二磷胆碱、脑蛋白水解物，也可以应用奥拉西坦和吡拉西坦。抗血小板聚集的药物一般应用阿司匹林。改善血液循环的药物，临床上常用的药物有舒血宁、维脑路通、川芎嗪，也可以用疏血通。
腔隙性脑梗塞的患者大多数病因为高血压、糖尿病，如果有高血压时，可以口服左旋氨氯地平、苯磺酸氨氯地平或者厄贝沙坦降血压治疗。如果患者有糖尿病时，一般情况下首选二甲双胍进行口服，对二甲双胍效果欠佳时，也可以同时加用拜糖平或瑞格列奈。
