儿童口腔念珠菌感染的主要原因有口腔存在炎症、防御功能差、药物滥用等。
1、口腔存在炎症：
儿童由于年龄较小，平时不注意口腔卫生，很容易出现牙齿龋坏、牙周炎等口腔炎症，进而会破坏口腔黏膜的完整性，从而引起口腔念珠菌感染的风险增加。
2、防御功能差：
白色念珠菌属于常见的口腔念珠菌，而人类血清中含有一种抗真菌的成分（血清因子）能抑制白色念珠菌生长，此外人体内的中性粒细胞、单核细胞和嗜酸性粒细胞也有消化及杀灭白色念珠菌的功能。由于儿童年龄较小，身体发育不完善，上述成分缺乏，可导致身体防御功能差，便可增加口腔念珠菌感染的风险。
3、药物滥用：
皮质类固醇激素能减弱网织内皮系统的功能，减轻炎症反应，减少抗体形成，但是另一方面皮质类固醇激素又能增加真菌活动能力，增强真菌的毒性。如果平时不遵医嘱用药，滥用皮质类固醇激素则容易引起口腔念珠菌感染。
除上述常见原因以外，也可能是口腔手术操作不当等原因导致的。
