引发淋病的病原体是“淋病奈瑟氏菌”，即俗称的淋球菌。这种病菌拥有自我调节能力，能够通过变异获得抗药性，或者至少使药物的下降，并且它正在对越来越多种类的抗生素发展出这种免疫力。
淋病奈瑟菌阳性正常吗？
不正常，淋病奈瑟菌成阳性就是淋病了，淋病是奈瑟淋病双球菌，也称淋球菌引起的泌尿生殖系统的化脓性感染，以排出脓性分泌物为主要特征。淋病主要是通过性交传染，为性传播疾病中发病率高的疾病。初发者常好发于尿道、即淋病性尿道炎。病情进一步扩散时，还可损害生殖系统和全身其他器官,可引起泌尿的慢性炎症，而导致不育或不孕。
淋球菌对柱状上皮和移行上皮有特别的亲和力。尿道，宫颈覆盖柱状上皮和移行上皮，故易受淋球菌侵袭，而舟状窝和阴道为复层扁平上皮覆盖，对其抵抗力较强，不受侵犯，或炎症很轻，淋菌性阴道炎少见。阴道黏膜为柱状上皮，因此易于受染。皮肤不易被淋球菌感染，罕见有原发性淋球菌皮肤感染。人类对淋球菌无先天免疫性，痊愈后可发生再感染。
淋球菌吸附于上皮细胞的微绒毛，其外膜蛋白I转移至细胞膜内，然后淋球菌被细胞吞噬而进入细胞内。淋球菌菌毛可吸附于精子上，可迅速上行到宫颈管。宫颈管的黏液可暂时阻止淋球菌至宫腔，而在宫颈的柱状上皮细胞内繁殖致病。淋球菌一旦侵入细胞，就开始增殖，并损伤上皮细胞。细胞溶解后释放淋球菌至黏膜下间隙，引起黏膜下层的感染。淋菌性尿道炎、宫颈炎、直肠炎，给予头孢曲松，或大观霉素肌注，或头孢噻肟肌注。次选方案为其他第三代头孢菌素类，如已证明其较好，亦可选作替代药物。如果沙眼衣原体感染不能排除，加上抗沙眼衣原体感染药物，还会引起淋菌性附睾炎、精囊炎、前列腺炎。
