甲状腺功能化验内容主要包括如下几项：
1、甲状腺素分泌指标
如血清总T3（TT3）、总T4（TT4）、游离T3（FT3）、游离T4（FT4）。分泌指标高低直接反应甲状腺的功能状态，增高表示功能增进，减少表示功能减低。T3、T4在妊娠、服避孕药、雌激素治疗等情况下可增高;在雄激素和强的松治疗、肾病综合征、肝功衰竭、服用苯妥英钠和保泰松时可减低，故对甲亢诊断准确性受到限制。
但FT3、FT4不受上述因素影响，是目前诊断甲亢、甲减的常用化验指标。但是多数医院常将TT3、TT4、FT3、FT4一起检查。FT3占总T3的0.3％，FT4占总T4的0.04％，含量虽然少，但生物活性极高，因为只有游离T3、T4才能进入细胞内，起到生理作用。
FT3在甲亢早期或复发初期先升高，对甲亢诊断意义大，而FT4甲亢时也增高，但甲减时先降低，对甲减诊断优于FF3。反T3（rT3）：95％以上由T4在周围组织代谢时脱碘形成，不具生理活性，对甲亢诊断意义不大，它在甲亢时与T3、T4、FT3、FT4同步升降，只是在甲亢或甲亢复发的早期先期升高，而且在非甲状腺疾病，T3、T4、FT3、FT4正常时，rT3可以独立升高。T3、T4在甲亢时常同步升高，但也有例外：
在脑垂体产生，有促进甲状腺滤泡细胞产生T3、T4、FT3、FT4的作用。它的高低受甲状腺素负反馈控制，其表现是相反的，甲状腺素高时，TSH低;甲状腺素低时，TSH高。故甲亢时T3、T4、FT3、FT4增高，而TSH是降低的，甲减时相反。
3、甲状腺免疫指标
常测定甲状腺免疫球蛋白（TG）（正常值
