由于目前没有特效的抗病毒药物，尖锐湿疣的治疗必须采用综合治疗，具体如下：

1、治疗诱因：如白带过多、包皮过长、其它性传播疾病等；

2、药物治疗：包括0.5％的足叶草脂毒素酊、50％的三氯醋酸、5％的咪喹莫特霜、15％的茶多酚软膏外用；

3、手术治疗：对于单发、面积小的湿疣，可以采用手术切除；对于巨大尖锐湿疣，可以用Mohs手术切除；

4、冷冻治疗：利用-190℃的低温液体氮压冻，促进疣体组织坏死脱落，本方法适于数量小，面积小的湿疣；本方法容易复发。

5、激光治疗：通常采用二氧化碳激光烧灼的办法，治疗尖锐湿疣，适用于外阴部位或阴茎、肛周的湿疣；

6、电灼治疗：采用高频电针或电刀切除湿疣，适用于数量少，面积小的尖锐湿疣；

7、微波治疗：采用微波治疗的手段，利用利多卡因局麻，将杆状辐射探头插入尖锐湿疣直达疣体基底，当看到疣体变小、颜色变暗、则热辐射凝固完成治疗；

8、干扰素治疗：干扰素具有抗病毒及调节免疫作用，仅用于辅助治疗。如α或β-重组干扰素，局部或病灶内给药；

9、光动力：光动力是利用激光、盐酸氨酮戊酸等光敏剂与氧相互作用治疗尖锐湿疣的新方法，是具有治疗率高，小，复发率低的特点，是目前治疗尖锐湿疣好方法之一。