导致孩子矮小的原因有很多，例如：

1、家族性矮小：一般父母身高较矮的，子女身高也矮。有时还会出现隔代遗传现象，父母不矮，但祖父母或叔伯姑舅姨矮小，孩子也会矮小。

2、内分泌系统异常：如甲状腺功能低下、糖尿病及垂体性侏儒症等都会引起孩子矮小。其中垂体性侏儒症就是平常经常讲到的生长激素分泌减少引起的矮小症，称为生长激素缺乏症。

3、中枢神经系统疾病：如出生前或出生过程中有缺氧导致新生儿缺氧缺血性脑病，脑积水、脑肿瘤及脑部手术、严重外伤等均可引起矮小症。

4、慢性消耗性疾病：例如儿童期的胃肠道吸收不良、尿毒症、肝功能异常、先天性心脏病等均可引起矮小症。

5、染色体异常：通常是先天性遗传性疾病如先天愚型（21-三体综合症）、先天性卵巢发育不全综合征（特纳综合征）等。

6、宫内发育不良：因胎儿在母亲体内缺氧、感染、营养不良等原因均可引起胎儿在子宫内发育不良，出生时身高体重均较同胎龄新生儿低，出生后也常会发生身高发育迟缓，终身高矮小。

7、骨病：如软骨发育不良、脊柱畸形等均可引起矮小症。

8、其他：如肾小管酸中毒、肝糖原累积症等代谢性疾病均可引起矮小症。

因此，引起儿童身高矮小的原因极其复杂，应该到医院去及时检查。在自己的孩子身高明显低于同龄儿童时，家长千万不要以为孩子发育迟所以长得慢而盲目等待。要是贻误了时机，到青春发育开始后再诊治就往往太迟了！