多项流行病学的调查显示，在不孕症中，男方因素约占35%，女方因素约占45%，不明原因性不孕约占10%，男女双方均有问题的占10%。在女性不孕中，输卵管性因素约占40%，排卵因素约占40%，不明原因约占10%，另外10％为不常见因素，包括子宫因素、宫颈因素、免疫因素等。
卵巢因素
卵巢发育不全、黄体功能不全、卵巢早衰、多囊性卵巢综合症、卵巢肿瘤等影响卵泡发育或卵子排出的因素都会造成不孕。排卵障碍是造成女性不孕症较常见的原因，没有成熟卵泡发育及排卵就不可能怀孕。排卵障碍包括完全没有排卵、很少排卵或是不规则排卵，临床表现为闭经、月经稀发或是子宫内膜不正常出血。多囊卵巢综合症就是因为垂体激素异常引起的排卵功能障碍，导致不孕。
输卵管功能障碍
在正常情况下，从卵巢排出的卵子，必须要能被输卵管的伞部拣拾。当卵子进入输卵管后，依靠输卵管内的纤毛运动将卵子向子宫腔方向运送，在输卵管1/3的地方卵子与精子会合并受精，在受精之后，受精卵进一步分裂形成早期胚胎，在排卵后的第4-5天，胚胎被运送到子宫腔，在子宫定居下来。
输卵管的功能有三：拣拾卵子，为精卵受精及早期胚胎发育提供养分，运送卵子、胚胎至子宫腔内。当输卵管因细菌感染发炎、子宫内膜异位症或手术后引起粘连，都会影响输卵管拣拾卵子及运送卵子的功能。细菌感染也会破坏输卵管内的纤毛，使胚胎没有办法被运送至子宫腔内正常着床，也不能提供适当的养分使早期胚胎发育。而输卵管功能障碍导致精子和卵子不能相遇就会发生不孕症。子宫颈和子宫
宫颈管先天性异常、闭锁或狭窄、息肉、糜烂、肿瘤、粘连等均可影响精子通过；宫颈粘液中存在抗精子抗体，不利于精子穿透宫颈管或完全使精子失去活动能力，均可以导致不孕症的发生。免疫学因素
指女性生殖道或血清中存在有抗精子抗体，引起精子互相凝集，丧失活力或死亡，导致不孕或不育。此外，部分不孕妇女的血清中存在有对自身卵子透明带抗体样物质，可阻碍精子穿透卵子受精，亦可引起不孕。中枢性的影响
丘脑下部、垂体、卵巢间内分泌平衡失调，垂体肿瘤或瘢痕都可以引起卵巢功能失调而致不孕；精神因素如精神紧张或过度焦虑，可对下丘脑-垂体-卵巢轴产生影响抑制排卵引起不孕。全身性疾患
如重度营养不良，或饮食中缺乏某些重要的营养因素，都可影响卵巢功能而致不孕；慢性疾病、代谢病如甲状腺功能低下或亢进、糖尿病、肾上腺功能紊乱等也能导致不孕。精液因素
由泌尿系统疾病、性传播性疾病及腮腺炎等因素引起的精液液化时间延长，少、弱精子症，无精子症，血精症，精子活力低下，高畸形率精子症，死精症，均可降低生育能力，甚至引起不育。
生殖功能障碍
男性器质性因素妨碍传导、不良生活习惯影响及消极心态等因素引起的阳痿、早泄、不射精、逆行射精等，无法将精子输至女性的宫颈口，导致男性不育。女性的性抑制、性厌恶、性欲高潮障碍、性交疼痛及阴道痉挛等亦可影响精卵相遇，导致不孕。
染色体因素
常见的有男性假两性畸形、克氏综合征和XYY综合征。染色体异常需要根据情况。有的是无法生育的，即使受孕也是反复胎停育后流产，畸形，死胎，无法保胎成功，目前是无法治疗的。
